Trước đó ngày 26/5 Tổng cục Thuế đã ban hành phiếu chuyển Công văn của Công ty Luật Diên Hồng về việc đề nghị xem xét chỉ đạo xử lý hành vi có dấu hiệu vi phạm hành chính trong lĩnh vực thuế của Công ty Thành Bưởi. Ngay sau đó ngày 7/6, Cục Thuế TP.HCM ra quyết định thanh tra thuế đối với Công ty Thành Bưởi.
Tuy nhiên, do không có đầy đủ số liệu để đối chiếu giữa kê khai thuế của Công ty Thành Bưởi và số lượng xe hợp đồng, số chuyến, hành trình, số lượng khách thực tế nên Cục thuế TP.HCM đề nghị Sở Giao thông Vận tải tải cung cấp và tạm dừng luôn cuộc thanh tra.
Đây là lý do khiến quá trình thanh tra nhà xe Thành Bưởi bị chậm lại và kéo dài suốt sáu tháng qua.
Tổng cục Thuế đề nghị Cục Thuế TP.HCM khẩn trương làm rõ nội dung tố cáo. Với các số liệu cần cung cấp của Sở Giao thông Vận tải TP.HCM, Tổng cục Thuế hướng dẫn Cục Thuế TP.HCM có văn bản báo cáo UBND TP.HCM đề nghị chỉ đạo Sở Giao thông Vận tải TP.HCM cung cấp thông tin kịp thời.
Trước đó Trung tâm Phát thanh, truyền hình, điện ảnh Công an nhân dân (Kênh ANTV) cũng đã có văn bản gửi Cục trưởng Cục Cảnh sát điều tra tội phạm về trật tự quản lý kinh tế và chức vụ (C46) đề nghị điều tra về tình trạng né thuế, có dấu hiệu bảo kê của xe Thành Bưởi sau loạt tài liệu chứng cứ của nhóm phóng viên điều tra.